茄子的種子扁平，呈腎形，顏色為赤黑色或黃色，有光澤。種皮有細紋而無毛。陳種子或采種時未洗干凈的種子呈淡褐色，失去光澤。種子的長度3.1～3.7毫米、寬度2.6～3.1毫米、厚度0.8～1.1毫米，千粒重4～5克，即每克種子200～250粒。茄子的種子由種皮、胚乳和胚組成。胚乳中充滿蛋白質(zhì)、脂肪等營養(yǎng)物質(zhì)，是種子萌發(fā)和出土時所需養(yǎng)分及能量的來源。
茄子種子的發(fā)育比果實發(fā)育遲，果實在商品成熟期采收時，種皮仍十分柔軟，并不影響食用。一般在開花后60天左右，當果實達到生理成熟（老熟）時，種皮才逐漸硬化，胚乳和胚發(fā)育完全，種子千粒重已趨穩(wěn)定，并且具備了良好的發(fā)芽力和發(fā)芽勢。
由于茄子的種皮為革質(zhì)，厚而堅硬，有蠟質(zhì)層，不易吸水透氣，并且種子在浸種催芽時表面會產(chǎn)生黏液，從而影響種子萌發(fā)。因此茄子種子發(fā)芽比辣椒、番茄等種子慢而困難。此外，因種子在采收后有幾周時間的輕度休眠，若采收后馬上播種，發(fā)芽率往往較低。并且，如果在恒溫條件下催芽，種子發(fā)芽率往往也不高。茄子種子的生命力很強，在通常室溫下，只要種子干燥，保持發(fā)芽能力的年限為5年，但生產(chǎn)上的使用年限為2年，陳種子的發(fā)芽率較低，尤其是發(fā)芽勢低，播種時常常出苗不齊，容易出現(xiàn)大小苗現(xiàn)象。所以生產(chǎn)上要盡量采用新種子，但也要注意不能使用尚未度過休眠期的種子。